Bakteriers evne til å feste seg til en celle ligger i overflateproteinene

-    Hvis vi kan hinder en bakteries evne til å feste seg til våre celler kan vi avvæpne dem i stedet for å drepe dem, forklarer Jack Leo, en forsker ved Institutt for biovitenskap ved Universitetet I Oslo.

Han og kollegene har sett på et protein kalt Intimin, som bidrar til at bakterier kan feste seg til våre celler. Et eksempel på en slik bakterie er enteropatogen E. coli som gir diaré. Intimin er en såkalt autotransporter, som betyr at den forårsaker sin egen utskillelse. Når Intimin er kommet til bakteriens overflate får den bakterien til å feste seg til tarm-veggen, som så gir sykdomssymptomene.
Hvis du kan blokkere Intimin hindrer du også bakterienes evne til å feste seg til våre celler.

Hittil har det vært et mysterium hvordan Intimin faktisk transporterer seg selv til utsiden av cellen. Intimin finnes i Gram-negative bakterier, det vil si bakterier som – i motsetning til våre egne celler – har to membraner. Dette betyr at å transportere noe over disse to barrierene krever ekstra energi. Bernstein og kollegene hans har argumentert for at protein-folding alene, ikke er nok til å krysse begge membranene.

-    I denne studien viser vi at det faktisk er protein-foldingen som gir energien til selv-utskillelsen, i alle fall for Intimin og liknende proteiner, konkluderer Leo.

Til tross for dette har ikke forskerne klart å finne hvor energien som setter i gang selv-utskillelsen kommer fra. Intimin virker ved at proteinet folder seg ut og det er denne prosessen som bokstavelig talt trekker resten av proteinet gjennom de to membranene. Uten at selve foldingen settes i gang skjer det imidlertid ingenting. Figuren viser hvordan Intimin folder seg ut av cellen domene etter domene. Et protein-domene er definert som en del av en protein-kjede som kan foldes uavhengig av de andre i en 3-dimensjonal struktur.

-    Vi satte inn en ”tag” der ved det første domenet i Intimin, og vi så da at protein-foldingen sluttet å fungere, forklarer Leo.

Vi forstår ikke hele prosessen, men det er et steg i riktig retning for å finne svakheter i bakterienes angrep på oss.